Μπορείτε να φθάσετε στην Αμοργό απο την Αθήνα με πλοία που αναχωρούν απο τα λιμάνια του Πειραιά και της Ραφήνας.
Το ταξίδι κρατάει, αναλόγως, απο 7 έως 9 ώρες με κοινά πλοία της γραμμής, και απο 4 έως 5 ώρες με ταχύπλοα σκάφη.
Πραγματοποιούνται δρομολόγια απο την Αθήνα για την Αμοργό κάθε 3 με 4 φορές την εβδομάδα κατα την περίοδο του χειμώνα και 6 με 8 φορές κατα την καλοκαιρινή περίοδο.
Σαν εναλλακτική λύση, προτείνεται η μετάβαση με αεροπλάνο στα κοντινά νησιά της Πάρου η της Νάξου, απο τα οποία νησιά υπάρχουν καθημερινά δρομολόγια μ τοπικά πλοία για την Αμοργό.
Κατα την θερινή περίοδο, η μετάβαση στην Αμοργό μπορεί να γίνει με τον συνδιασμό αεροπορικής μετάβασης απο Αθήνα ως την Σαντορίνη και απο εκεί με την χρησιμοποίηση ταχύπλοου σκάφους. Την διαδρομή αυτή το ταχύπλοο σκάφος την διανύει μέσα σε 50 λεπτά.
Η Αμοργός διαθέτει, επίσης, ενα πλήρως εξοπλισμένο ελικοδρόμιο.
Το ταξίδι με το ελικόπτερο διαρκεί 60 λεπτά και γίνεται κατόπιν ιδιωτικής συμφωνίας.